Hoe bouw je een genoom?

Bacterie met synthetisch DNA

Bacterie, model E. coli, met synthetisch DNA (afb: univ. van Cambridge)

Makkelijk zat, zegt iemand die een beetje is ingevoerd. Je plakt de verschillende nucleotiden (ook wel aangeduid met basen, de bouwsteen van het DNA) aan elkaar en gaat daarmee door tot je je bij het eind bent. Tja, zoiets is het wel, maar makkelijk is het niet. Tot voor niet zo heel lang geleden kwamen bedrijven die stukjes DNA synthetiseren voor onderzoeksdoeleinden niet veel verder dan zo’n duizend nucleotiden. Je kunt wel verder gaan, maar dan wordt het aantal fouten in je syngenoom te groot (vooropgesteld dat je een bepaald genoom wil synthetiseren en niet zo maar wat). Vaak werd voor langere stukken de hulp van bacteriën ingeroepen om die korte stukjes aan elkaar te plakken zo zijn ook de eerste bacteriegenomen ‘gesynthetiseerd’ en die zijn vele malen kleiner dan genomen van zoogdieren. Daar hebben we het over miljarden nucleotiden. Inmiddels lijkt de ontwikkeling zo ver gevorderd dat we een stuk verder komen tot chromosomen of zelfs hele genomen. Nog niet in de orde van miljarden basen, maar wel van een miljoen…
Lees verder

Craig Venter stort zich op het ‘eeuwige leven’

J. Craig Venter

J. Craig Venter

De man die zijn naam verbond aan de eerste ‘aflezing’ van het menselijk genoom en aan een bacterie met een geheel ‘gesynthetiseerd’ genoom, J. Craig Venter, kondigt aan zich op het ‘eeuwige leven’ te storten. Venter begint een nieuw bedrijf, Human Longevity. Hij hoopt dat het geheim voor een lang leven in de genen is te vinden. Daartoe zal, wat Venter noemt, de grootste sequentie-operatie ter wereld worden opgezet. Het is de bedoeling jaarlijks 40 000 genomen te ‘lezen’.  Lees verder